W fikcyjnej historii gry, zanim Dr. Light skonstruował Mega Mana utworzył Proto Mana. Był to jego pierwszy robot korzystający ze sztucznej inteligencji, który zaraz po stworzeniu stał się zły i uciekł. Dr. Light doszedł do wniosku, że Proto Man uciekł, ponieważ był samotny, dlatego postanowił stworzyć dwójkę robotów Rock’a – asystenta do pomocy w laboratorium i jego siostrę Roll do domowych robótek. Roboty działały jak trzeba, więc doktor zabrał się za budowę kolejnych robotów: Cutman, Gustman, Elecman, Iceman, Fireman i Bomban.

Doktor Light osiągnął sukces i został doceniony przez innych naukowców na całym świecie. Jednak nie dokonał wszystkiego sam. Pracował razem z Dr. Wilyem, jednak ten on pozostał w cieniu. Wkurzony Wily postanowił zemścić się na Dr. Lighcie. Miał szczęście, ponieważ spotkał umierającego Proto Mana. Naprawił go, a następnie wykorzystał jego technologie do stworzenia własnego robota policjanta – Snipera Joe. Następnie opracował się chytry plan – zakradł się do laboratorium i ukradł szóstkę robotów Lighta. Przeprogramował je, by wykonywały jego złowieszcze rozkazy. Gdy Dr. Light zobaczył co się stało, ulepszył Rocka, by i on mógł walczyć. Tak powstał Mega Manem.
Gier z Mega Manem licząc wszystkie remaki jest już ponad 100. Mamy 7 głównych serii, do tego części poboczne, spin-offy, oraz całą masę gier na telefony komórkowe. Główne serie gry to: Mega Man - pierwsza seria gry rozpoczynająca historie; Mega Man X - kontynuacja pierwszej serii, akcja toczy się 100 lat później, a głównym bohaterem jest Mega Man X; Mega Man Legends - seria jedynych w pełni trójwymiarowych zręcznościówek, akcja toczy się kilka tysięcy po wszystkich innych seriach; Mega Man Battle Network - jRPG na podstawie Mega Mana; Mega Man Zero - kontynuacja Mega Man X, w grze wcielamy się w Zero - jednego z bohaterów serii X; Mega Man ZX - spin-off Mega Mana Zero; Mega Man Star Force - Kontynuacja Battle Network.